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注册了顺风车，车辆不会变成营运车。因为顺风车不算营运车辆，只是车主利用网络平台将出行路线信息提供给需要的人，分摊出行成本或者提供便利服务，并不以盈利为目的。因此，车主不需要办理相关营运证件和手续。但如果车主选择办理营运证件和手续，那么车辆就属于营运车辆。
如果车主已经注册了顺风车，并且误操作导致车辆变成了营运车，可以采取以下方法处理：
1、联系当地的交通管理部门或相关机构，了解如何撤销或更正车辆的性质，根据不同地区的规定和政策，可能需要提供相关证明材料和办理相关手续。
2、如果车主已经按照营运车辆的规定办理了相关手续，那么需要了解当地关于营运车辆的退出机制和相关政策，通常情况下，车主需要满足一定的条件并办理相关手续才能退出营运状态。
车主需要根据当地的政策和规定来处理车辆性质问题，如有疑问可以咨询相关部门或专业律师的意见。